Die Tradition nennt Karl den Grossen als Gründer des Klosters Münster. Die Darstellung orientiert sich an der Statue in der Klosterkirche. Die Farben stammen vom Klosterwappen.

Müstair war bis zum 31. Dezember 2008 eine politische Gemeinde im Val Müstair. Per 1. Januar 2009 fusionierte Müstair mit den übrigen Schweizer Gemeinden der Talschaft (Fuldera, Lü, Santa Maria Val Müstair, Tschierv und Valchava) zur Gemeinde Val Müstair. Das Verwaltungszentrum der Gemeinde ist in Müstair.

1850 hatte Münster 475 Einwohner und erhielt eine Postablage.