In Filisur gab es bereits erste Siedlungen in der Bronzezeit. Dies belegen bronzezeitliche Fragmente, die gefunden wurden. Doch der Name Filisur selbst wird erstmals im Jahre 1262 als villa Fallisour erwähnt. Die Burg Greifenstein oberhalb Filisur war zunächst Sitz der Herren von Greifenstein, eines hochadligen Bündner Geschlechts aus dem 13. Jahrhundert. Später war die Burg Sitz der bischöflichen Vögte mit Höfen im Dorfbereich.Filisur wurde bis Ende des 19. Jahrhunderts weitgehend germanisiert. 1914 wurde Deutsch zur Hauptsprache der Menschen in Filisur und löste damit das Romanische ab. Auch heute noch, ein halbes Jahrhundert später, sprechen einige ältere Einwohner noch das „Filisurer Romanisch” untereinander.

Filisur hatte 1850 280 Einwohner, seit 1844 eine Poststelle und 1850/51 für 10 Monate ein Postbureau, dann würde es wieder zur Postablage zurückgestuft.